М. И. Аполлонов родился 7 ноября 1946 г. в с. Кузминовке Октябрьского р-на Оренбургской обл.
Август 1966 г. — август 1967 г. — матрос, младший контролер войсковой части Тихоокеанского флота.
1967-1971 гг. — курсант Киевского высшего военно-морского политического училища.
1971-1974 гг.: с сентября — заместитель по политчасти командира транспорта «Мегра», с ноября 1971 г. — морского танкера «Дунай» 604-го дивизиона 109-й бригады вспомогательных судов тыла Тихоокеанского флота. 1974—1980 гг.: с апреля — старший инструктор отдела комсомольской работы Политуправления Тихоокеанского флота, с июня 1975 г. — Политуправления Военно-морского флота.
1980-1985 гг. — заместитель начальника политотдела 2-й дивизии противолодочных кораблей Северного флота.
В июне 1984 г. окончил с отличием Военно-политическую академию им. В. И. Ленина заочно.
1985-1988 гг. — начальник политотдела — заместитель по политчасти командира 37-й дивизии морских десантных сил Северного флота.
Апрель 1988 г. — январь 1989 г. — 1-й заместитель начальника политотдела Приморской флотилии Тихоокеанского флота.
1989-1992 гг. — начальник отдела пропаганды и агитации — заместитель начальника Политического управления Тихоокеанского флота.
1992-1994 гг.: с марта — заместитель начальника аппарата по работе с личным составом; с марта 1994 г. — начальник управления по работе с личным составом Тихоокеанского флота.
Ноябрь 1994 г. — декабрь 1995 г. — начальник Направления воспитательной работы ВМФ.
С 23 декабря 1994 г. — контр-адмирал.
1995-1998 гг. — заместитель главнокомандующего ВМФ по воспитательной работе.
С 27 июля 1996 г. — вице-адмирал.
С 15 сентября 1998 г. — в запасе в связи с оргштатными мероприятиями. Награжден орденами «За службу Родине в Вооруженных силах СССР» III ст., «Знак Почета», медалями.
1998-2006 гг. — генеральный директор Фонда содействия укреплению флота «Москва — Севастополь».
В настоящее время вице-адмирал Аполлонов М.И. является Председателем Общероссийской политической общественной организации «Российское морское собрание».
При подготовке публикации использовались материалы с книги Барсуков И.И., Йолтуховский В.М., Кондрашов А.В. Адмиралы и генералы Военно-Морского Флота. Руководители структур политической и воспитательной работы. Биографические хроники (1917-2013). – М.: Клуб адмиралов. Кучково поле, 2014. – 432 с.