- Партийно-политической работы
- Истории КПСС
- Марксистско-ленинской философии
- Военной педагогики и психологии
- Политической экономии и военной экономики
- Научного коммунизма
- Кораблевождения
- Тактики Военно-Морского Флота
- Технических средств кораблевождения
- Устройства, живучести корабля
- Общенаучных и технических дисциплин
- Иностранных языков
- Физической подготовки и спорта
Профильными кафедрами училища являлись кафедры партийно-политической работы, истории КПСС и кораблевождения (по количеству учебных часов не уступала соответствующим штурманским факультетам высших командных училищ ВМФ). С годами наименование кафедр изменялось, увеличивалось или сокращалось их число. Менялись названия предметов, изучаемые на них, приоритетность их преподавания и количество учебных часов. Так, например, первоначально преподаватели научного коммунизма входили в состав кафедры «истории КПСС», а кафедра «устойчивости, живучести корабля» называлась ТУЖЭК (теории, устройства, живучести и электрооборудования корабля). Но, самые кардинальные изменения произошли на завершающем этапе так называемой «перестройки» в СССР. В 1990 г. появились такие названия кафедр, как: военно-политической работы, истории, философии, теории социализма и политологии, боевой подготовки. Большой интерес не только среди курсантов, но и офицерского состава училища вызывала работа кафедры военной педагогики и психологии. С помощью преподавателей этой кафедры ряд их коллег из других кафедр, в том числе и военных, защитил диссертации по психологии и педагогике.
